Инопланетяне Гауна уничтожили солнце и так как эти инопланетяне не обладают разумом и являются огромными и сильными существами, людям очень тяжело было с ними справится. Чтобы спастись от смерти, люди улетели из Земли на пилотируемых кораблях под названием Сидония, которые стали для них родным домом. Он летают по просторам бесконечной Вселенной и спасаются от преследований инопланетян Гауна, которые хотят их уничтожить. Одним из таких спасшихся оказался Нагатэ Таникадзэ, который как оказалось обладает талантом к управлению боевыми технологиями и поэтому именно он становится пилотом одного из боевых роботов, которые призваны вступать в драку с Гауна и защищать людей от их разрушительных действий. Он постепенно становится очень сильным и влиятельным воином, который способен в бою уничтожать Гауна и приносить большую пользу людям в войне с ними, за что его все уважают. Со временем становится ясно, что именно Нагатэ станет тем элементом, который должен будет уничтожить противников и спасти человечество от вымирания.
